Pengurusan koleksi adalah proses utama bagi prosedur koleksi-koleksi dimiliki muzium haruslah disimpan bagi mengelakkan kerosakan akibat faktor fizikal, biologi dan kimia seperti suhu dan kelembapan.

​

       Bagi muzium tamadun mesir purba kami akan melaksanakan penyimpanan dipusat pusat konservasi bagi artifak yang telah melalui proses pendaftaran artifak dan telah dikodkan. Di muzium Tamadun Mesir Purba terdapat dua unit pengurusan koleksi iaitu Unit Pendaftaran dan Unit Ripositori.

​